PedigreeDAO

2SLab Pleco MPA Kit1.0 (2SLab Pleco Molecular Phylogenetic Analysis Kit1.0) のご紹介です。

次世代シーケンスによる小型プレコのゲノム解析サービスです。

小型プレコの遺伝的背景について、エビデンスに基づくデータ解析結果をご提供いたします。
小型プレコの表現型（見た目）ではなく、遺伝子型（血統）に基づいたSNPジェノタイピング解析になります！

小型プレコのゲノム塩基配列中におけるSNP（一塩基多型）を検出し、得られたSNPマーカーによる種内の系統発生解析^《注1》及びSTRUCTURE解析^《注2》を行います！

解析フローは、✔︎サンプルDNA抽出→ ✔︎ライブラリー作製→ ✔︎シーケンス解析→ ✔︎データ解析（系統発生解析・STRUCTURE解析）です。

◎ゲノム未解読生物種にも対応可能です。

＊価格は、16,000〜18,000円/サンプルです。
＊販売数（初回ロット）は、40サンプル程度です。
＊DNA抽出用サンプルは、尾ビレ先端切片になります。（非侵襲的な環境DNAによる解析も検討中ですが、現状未定です。）
＊データ解析は、系統発生解析及びSTRUCTURE解析になります。
＊納期は、4〜6ヶ月（販売〆切後3ヶ月程度）です。
＊納品物は、データ解析結果になります。

※全サンプルデータは、入手できない可能性がございます。
※データに関連する知的財産は、弊社に帰属いたします。
※データ解析結果の二次使用は、お断りいたします。

ゲノム解析サービスは、2SLab Storeで販売いたします。
よろしくお願い申し上げます。

《注1》系統発生解析：ソフトウェアStacksによるde novo（新規）アセンブル及び、ソフトウェアRAxMLによるGTR+gammaモデルの最尤法から、系統樹を作成。
＊参考サイト（JST HPより）→分子系統解析
《注2》STRUCTURE解析：ソフトウェアSTRUCTUREにより、集団における遺伝的構成の違いを可視化。
＊参考サイト（NARO HPより）→STRUCTUREを用いた遺伝的集団構造解析

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